Zoekveld

CoVID-19: een zeer nuttige karakterisering!
24/02/2020 - 02:04
Foto: Shutterstock

Het is zeker nuttig om meer te leren over het nieuwe coronavirus dat zich nu over de aarde  verspreidt. Onderzoekers hebben zojuist interessante gegevens gepubliceerd in de Lancet, niet alleen vanuit een epidemiologisch oogpunt, maar ook over de receptoren die het bereikt ...

Zoals we weten is de epidemie begonnen in China. De eerste slachtoffers ontwikkelden een tot dan toe onbekende virale longontsteking. Onderzoekers gebruikten de nieuwste generatie sequencing, NGS, om een volledige sequentie van het genoom van dit nieuwe virus te verkrijgen. Ze hebben de fylogenetische gegevens ervan vergeleken met andere bekende coronavirussen, waaronder SARS.

Uit de uitgevoerde analyses bleek dat bij alle monsters de sequenties 99,98% gelijk waren. Deze sequenties zijn vergelijkbaar met twee bekende SARS-virussen die in vleermuizen worden aangetroffen. Bij de menselijke SARS- of MER-virussen (Middle-East Respiratory Syndrome) ligt CoVID-19 daarentegen verder weg, omdat ze respectievelijk slechts 79% en 50% van het genoom delen. Fylogenetische analyse toont aan dat CoVID-19 behoort tot het subgenus Sarbecovirus van het geslacht Betacoronavirus, dat verwant is aan het bovengenoemde vleermuisvirus.

Voor de onderzoekers is het duidelijk dat CoVID-19 voldoende verschilt van het SARS-virus om te worden beschouwd als een nieuwe besmettelijke ziekte die wordt veroorzaakt door een betacoronavirus. Hoewel analyses suggereren dat vleermuizen de oorspronkelijke gastheer van het virus kunnen zijn, is het waarschijnlijk dat een ander dier dat op de Wuhan Vismarkt werd verkocht een faciliterende gastheer was. Bovendien zou een structurele analyse van CoVID-19 aantonen dat het in staat is om zich te binden aan de angiotensine-2-omzettingsenzymreceptor in de mens. Deze informatie zou, indien bevestigd, een potentiële therapeutische weg bieden. Om deze reden suggereren de onderzoekers dat het dringend noodzakelijk is om de evolutie, aanpassing en verspreiding van het virus verder te onderzoeken om het effectiever te kunnen bestrijden.

Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding